华为P50和P50 Pro的主芯片差异最大，标准版的P50仅有骁龙888 4G版芯片，而P50 Pro则包含骁龙888 4G和麒麟9000 4G版本。
配色上，P50标准版有黑白金三色，但Pro版本多了粉色和涟漪云波蓝色版本。 尺寸上，标准版P50为156.5*73.8*7.92mm，重181克。Pro版为158.8*72.8*8.5mm尺寸，重量195克。厚度和重量上标准版均占优，屏幕大小相差不大。 屏幕上，标准版P50是6.5寸OLED直屏，刷新率是90Hz，Pro版则是6.6寸的120Hz满溢四曲面OLED屏，都是P3色域10亿色。 存储组合，标准版P50仅有8GB内存版，存储有128和256GB两个版本，而Pro版则多了12GB内存版本，同时多了512GB存储组合。 在后置摄像头上，主摄是5000W彩色原色镜头，在Dxomark上已经刷到144分，摄像头方面被评为“所有领域的翘楚”。
两个版本都没有RYYB，但替换了更高透光的镜片，加上XD Optics 计算光学、XD Fusion Pro 图像引⁠擎，在细节和色彩还原上表现更好。但Pro版本多了4000W黑白原色镜头。 但长焦上，P50标准版是1200W长焦，5X光学变焦和50倍数码变焦，而P50 Pro是3.5倍的6400W长焦，等效10X光学变焦，100X数字变焦。
前置摄像头，均是1300W超广角自拍，但是Pro版本多了自动对焦功能。 电池上，P50是4100mAh，而Pro版本是4360mAh。充电功率大小一样，但Pro版本多了50W无线快充。 最后，在WIFI芯片上，使用骁龙888版本的P50和P50 Pro版本的上传下载总速度更大，3.6Gbps，高于麒麟9000版本的P50 Pro的2.4Gbps。 但是使用麒麟9000的版本，其定位芯片支持北斗4频，伽利略3频，这点与骁龙888的版本有些差异，当然，实际使用下来，导航定位方面的体验并无大的感知。
其他方面，两款机型均支持IP68防尘防水功能，蓝牙5.2，LDAC等，数据接口都是USB 3.1 Gen 1。